根据DNA痕迹识别河流中的鱼类

根据DNA痕迹识别河流中的鱼类

当它们游来游去时,鱼会在身后留下DNA片段。鸣谢:Altermatt实验室/Eawag

(蜘蛛网eeook.com)据瑞士国家科学基金会:当它们四处游动时,鱼会留下DNA片段,例如通过它们的皮肤或排泄物。一旦收集和分析,这些指标允许科学家确定环境中存在的所有物种。更重要的是,该方法比通常用于此目的的电捕鱼更精确、更简单且对鱼的伤害更小。

这是最近发表在《加拿大渔业和水产科学杂志》上的一项大规模研究的结论。

科学侦探的河流

这项研究由苏黎世大学水生生态学教授兼Eawag实验室负责人Florian Altermatt领导。他解释说,“在过去,对河流生物多样性的清点通常每五年才进行一次,这不足以正确跟踪生物多样性。”

此外,调查清单仅基于标本的形态鉴定,通常是通过电捕鱼获得的。这种方法——在瑞士被授权仅用于科学目的——包括通过吸引鱼和用电流击昏它们来使它们浮出水面。

科学家们现在正在寻找测量水生生物多样性的新方法,这种方法将更容易使用,也更符合伦理,Altermatt的团队正在将他们的努力集中在环境DNA上。

“环境DNA”是指生物体遗留下来的DNA片段。一旦捕获并使用基因工具进行分析,就有可能识别它们所属的物种。“这些碎片揭示了某一特定区域——或其附近——的某些物种的存在,例如所考察地点的上游。这有点像在犯罪现场发现的DNA,”教授解释道。

瑞士研究了大约90个地点

在瑞士,这种技术已被应用于所有河流的尺度,从而提供了一个非常大尺度的视角。Florian Altermatt和他的团队检查了瑞士境内的89条河流。

在每个地点,科学家们收集了2升河水,并从中提取了环境DNA。通过将提取的DNA与鱼类DNA序列的大量数据进行比较——这是一个几乎穷尽的DNA图谱库——他们能够确定水中发现的序列所属的物种。

为了评估该方法的准确性,他们随后根据30多年来收集的历史数据,将已确认的物种列表与该地点可能发现的完整物种列表进行了比较。在三分之二的地点,该方法还与电捕鱼技术进行了比较。

结论:环境DNA是估算河流生物多样性的可靠方法。结果与历史数据一致,这种方法使得检测比单一的电捕鱼事件更大的物种多样性成为可能。“有了环境DNA,我们还可以识别生活在采样点上游的物种或难以用电捕鱼捕捉的物种,”研究人员说。




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