红树林长期被认为是荒凉的沼泽，曾被广泛砍伐，以进行沿海开发。现在，它们是世界上最濒危的生态系统之一。红树林沼泽经常出现在珊瑚礁附近，珊瑚礁鱼的鱼苗可以看到生活在红树林树根间，但红树林沼泽对珊瑚礁鱼的重要性却从未被测量过。现在，对伯利兹和墨西哥沿海的珊瑚礁所做的一项研究显示，珊瑚礁鱼群落的结构和多样性严重依赖于红树林的有无。红树林的培育使得一些具有重要商业价值的鱼类的生物量加倍，使得珊瑚礁鱼群落的多样性得到加强。红树林的损失已导致大西洋最大食草鱼彩虹鹦嘴鱼局部灭绝。目前砍伐红树林的速度影响到该地区渔业生产的发展，导致珊瑚礁严重退化。
